1986年 切爾諾貝利電站事故后不久 蘇聯(lián)就秘密開始在核電站內(nèi)搞一些秘密試驗 涉及人類精神領(lǐng)域的 為了制造出精神控制類的武器 最后造出個名為C-Consciousness的東西 但是試驗還沒取得成功 蘇聯(lián)就解體了 隨后的動蕩和混亂 也就沒人再關(guān)注這個事情了 但是C-Consciousness卻覺醒了 擁有自我意識 悄悄的掌控了蘇聯(lián)遺留的資源并繼續(xù)進行著試驗 其中一個試驗就是試圖精神控制更廣泛的世界 結(jié)果幾次試驗失?。ò?006年發(fā)生的第二次爆炸）導致核電站周圍駐扎的軍隊和科學家以及切爾諾貝利的生態(tài)系統(tǒng)受到影響發(fā)生突變
C-Consciousness為了掩蓋這一切也為了阻擋那些能深入到核心區(qū)THE ZONE（也就是核電站）的潛行者 在電站里造了個巨石 名為許愿石 以此吸引并對到許愿石的潛行者進行洗腦控制 也就誕生了黑石組織 奉許愿石為尊 替C-Consciousness看守核電站不受外界打擾 為保萬一 C-Consciousness還另造了一處名為焦腦器的設施 作為第一層屏障 可以毀滅接近它的人的大腦意識 使之變成行尸走肉 盡管如此 核心區(qū)里有更高級的神器以及許愿石的傳說還是吸引一批又一批的潛行者們前赴后繼的試圖深入到核心區(qū)THE ZONE中 當然大多數(shù)人都是一去不復返了

話說一支特別小組出現(xiàn)了 因為成員正好四個人 我們姑且稱之為F4(folly 4) 包括我們原版的主角史小強 兩部都沒露面的死鬼FANG 原版以一具尸體形象出現(xiàn)的GHOST 以及“醫(yī)生” 這四人冒險深入到核心區(qū)試圖接近許愿石 結(jié)果遭到看家護院的黑石組織的圍攻 突圍中 史小強被爆炸炸昏 其他三人沖出重圍 但是不久FANG就因為傷重不治 GHOST死于輻射風暴 醫(yī)生失蹤

昏迷的史小強被C-Consciousness發(fā)現(xiàn) 但是C-Consciousness卻并不知道這個潛入者的身份 在他的PDA上留下了殺害史小強及其同黨的任務 然后送史小強出境 于是在原版的開篇 午夜一輛卡車急馳在公路上 結(jié)果一個大雷劈中 連人帶車翻到路邊溝里 昏迷的史小強被打醬油路過的路人甲救起 送到新手村地窖商人那里 蘇醒的史小強得了游戲或是影視劇里常見的失憶癥（嗯 這么俗套的劇情竟然再次使用在資料片晴空里 太雷了） 只看見PDA上留下的干掉史小強的任務 腦殘狀態(tài)下的史小強已經(jīng)連自己就是史小強這個基本事實都不記得了 為了完成任務也為了弄清楚自己到底是誰 于是開始了冒險的旅程 在出龍?zhí)度牖⒀?得見老友“醫(yī)生”并在他的幫助下找回了失去的記憶（并得到影響游戲結(jié)局的道具--解碼器） 于是史小強再度向THE ZONE進發(fā)了 沖破層層阻力后終于來到了幕后元兇C-Consciousness面前 史小強非同小可的實力讓C-Consciousness刮目相看 漸生愛才之心 想收服史小強為己所用 它提出讓史小強入伙 將來統(tǒng)治天下（也就是給你兩個選擇） 正義的史小強當然拒絕了C-Consciousness的利誘 于是C-Consciousness派出了爪牙黑石組織企圖殺掉史小強 小強豈是白叫的 咬咬牙 解決掉這些烏合之眾 最后小強摧毀了C-Consciousness裝置 挽救世界于水火之中 鏡頭一轉(zhuǎn) 風和日麗的草地上 一切看起來那么的和諧 一個熟悉的身影 史小強站在草地上......